在食品饮料、生物发酵、制药行业设备制造、安装以及后期维护过程中，工业内窥镜可用于对容器、管道内部焊缝成形状况及清洁度的检查。

在管道安装时，管道的内部环境必须要符合相关要求，要保证管道内焊缝的平整和均匀，否则直接可能在其罅隙内部产生液体残留，容易滋生细菌，导致污染。要保证内部不能存在适合细菌生长的环境，洁净管道在焊接时应采取合理的施焊方法和施焊顺序，保证焊接表面焊缝外观均匀美观，焊接品质优良，没有焊接缺陷方可投入使用。

洁净管道的安装要求非常严格，因此对焊缝的质量要求很高，焊缝质量直接影响液体的污染程度，必须采用专业工具进行检验，要求对于所有完成的自动焊接，至少需要对自动焊接以及所有手工焊接进行工业内窥镜检测。

检验标准位焊缝与母材平滑过渡，内表面无明显的内凹或者外凸，焊波均匀，平直、无焊偏，无砂眼，无裂纹，焊缝无过热过烧等。焊缝内外表面与母材光亮基本一致，呈银白色，热影响区不变色，且不得有裂纹、夹层等缺陷。所有的焊缝应没有蚀损斑、针孔、腐蚀标记和点固焊缝印记等，内外表面无明显凹凸，焊波均匀、顺直。焊口焊接好后，根据内窥镜检测规程，对焊缝进行检验，检验标准必须符合设计规范要求，不合格焊缝必须按照返修规范进行返修。

在食品饮料、制药行业，人们对于洁净管道内清洁度的要求是非常高的，除了对焊缝的检测外，还要在投入使用前以及日常的清洁过程中，对其充分进行高压清洗、消毒和干燥，对微生物的数量进行控制，避免对需要输送的液体产生污染，如饮料、乳制品等液体的输送，管道的洁净度尤为重要。需要对内部的菌落、异物、杂质要进行严格的控制，保证食品的卫生，避免污染。工业内窥镜则可采用直接图像观测的方式，进行清洁度的检测，观测其内部是否清洗干净，是否存在液体残留情况。